A composição do Conselho Administrativo da ABRAPEE é formada por 35 membros, sendo:
Diretoria Executiva Nacional - Eleita em Assembleia.
- Presidente;
- Vice-Presidente;
- Secretário Geral;
- Tesoureiro;
- Diretor Jurídico.
Conselho Fiscal - Eleito em Assembleia.
- Conselheiro Fiscal;
- Conselheiro Fiscal Adjunto.
Coordenação Executiva - Nomeada pela Diretoria Executiva.
- Coordenador de Comunicação e Imprensa;
- Coordenador de Tecnologias Educacionais;
- Coordenador de Esportes, Recreação e Lazer;
- Coordenador de Gestão e Legislação Educacional;
- Coordenador de Cursos Livres, Capacitação e Qualificação Profissional;
- Coordenador de Educação Básica: Infantil, Fundamental, Médio e Técnico;
- Coordenador de Ensino Superior: Graduação, Pós-Graduação e Extensão;
- Coordenador de Programas e Projetos;
- Coordenador de Convênios com organizações governamentais e não governamentais, nacionais e internacionais;
- Coordenador de Eventos Científicos e Culturais;
- Coordenador para a Defesa dos Direitos dos Profissionais e Especialistas em Educação;
- Coordenador de Organização Administrativa e Institucional;
- Coordenador de Benefícios para Associados;
- Coordenador de Avaliação e Acompanhamento de Indicadores Educacionais.
Coordenação de Articulação Política e Extensão Regional - Nomeada pela Diretoria Executiva.
- Coordenador Nacional;
- Coordenador da Subsede Sul;
- Coordenador da Subsede Sudeste;
- Coordenador da Subsede Centro-Oeste;
- Coordenador da Subsede Norte;
- Coordenador da Subsede Nordeste.
Conselhos Temáticos - Nomeados pela Diretoria Executiva.
- Conselho da Mulher;
- Conselho da Infância e Juventude;
- Conselho da Pessoa com Deficiência;
- Conselho de Promoção da Saúde;
- Conselho de Participação e Cidadania;
- Conselho da Diversidade Étnico-Racial;
- Conselho da Preservação da Cultura Indígena;
- Conselho do Meio Ambiente.